Proses penentuan SPP di SMP Santo Thomas saat ini hanya mempertimbangkan pada hasil wawancara melalui tukar pendapat, sehingga penentuan SPP yang terjadi tidak berdasar pada keobjektifan kondisi keluarga, membuat ketidaksesuaian tanggungan biaya pendidikan dengan ekonomi keluarga. Dalam meningkatkan keobjektifan dan akurasi dalam proses penentuan SPP, diperlukan sistem yang dapat menunjang dalam proses penentuan ini, sistem penunjang keputusan menggunakan metode Fuzzy C Means dapat memberikan rekomendasi dalam proses penentuan SPP yang diterimakan ke orang tua. Dalam penerapannya metode ini membutuhkan data kriteria yang digunakan dalam proses penentuan SPP meliputi penghasilan orang tua, jumlah tanggungan anak, pekerjaan orang tua, jenis tempat tinggal dan jenis transportasi. Sistem yang dibuat diharapkan dapat membantu penata usaha dan pewawancara/guru dalam mengolah penentuan SPP yang lebih objektif dan akurat sesuai dengan kondisi orang tua. Hasil yang didapatkan dari implementasi metode Fuzzy C Means pada sistem yang dibangun menunjukkan bahwa sistem dapat memberikan rekomendasi SPP yang layak sesuai data yang di proses, memberikan nominal SPP dengan waktu yang cepat dibandingkan proses wawancara melalui tukar pendapat yang membutuhkan waktu yang lama, dan dari hasil perhitungan juga didapatkan hasil 3,30% kenaikan lebih tinggi dari nominal SPP nyata siswa. Dengan demikian, sistem ini tidak hanya mempermudah dalam penghitungan penentuan SPP, tetapi juga dapat mengingkatkan objektifitas, dan keakuratan dalam penentuan SPP yang sesuai dengan kondisi keluarga siswa di SMP Santo Thomas.